Когда человечество не пытается уничтожить себя само, ему охотно помогают внешние обстоятельства — такие, как пришельцы из космоса, называемые «БЕТА», чье вторжение привело людей на грань гибели. С БЕТА нельзя вести переговоры, и милосердие им неведомо, так что людям приходится стиснуть зубы и взять в руки оружие. «Черные метки» — это история о тех, кто спасает человечество от неминуемого уничтожения, то и дело рискуя собственной жизнью.
События, происходящие во вселенной «Muv-Luv Alternative», берут начало в 1983 году и рассказывают о военных силах Восточной Германии, которым и было дано название «Черные метки». Это особое подразделение, которое борется с БЕТА нестандартными способами — благодаря оригинальной тактике и смекалке. Бойцы, вооруженные боевыми роботами, держат в своих руках судьбу Родины и всей Земли, их приказы имеют высший приоритет, а военные операции нередко принимают неожиданный оборот. Но прежде всего, они простые молодые люди, которым приходится бороться не только с БЕТА, но и с собственными чувствами.
