16-летний Сидо Ицука в раннем детстве остался без родителей и теперь вместе с младшей сестрой Котори обитает в пригороде Токио. Однажды из-за сестры Ицука оказался прямо в эпицентре катаклизма и узнал, что неведомые Духи являются на Землю....

15-летний Нэку Сакураба приходит в себя в торговом районе Сибуя в Токио. Он не помнит, как здесь оказался, а в руке у него — черные значки, благодаря которым парень начинает слышать мысли окружающих. Вскоре на его телефон приходит сообщение — «Дойди до 104 за 60 минут, иначе исчезнешь». Так Нэку попадает в «Игру жнецов»....

Действия происходят после двух сезонов одноименного сериала. Здесь зрителей ждут прежние герои, и, как всегда, город Тэнгу, где и разворачиваются события аниме. Неизвестная огромная прозрачная сфера каким-то немыслимым образом поглотила целый город и всех его жителей, а из сферы исходят волны, имеющие энергию. Никто из людей не понимает, как она возникла и для чего она необходима. Вместе с этими происходящими событиями в городе появилась новенькая девушка, которую никто до этого не знал и не...